Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNB1P01574 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms