Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CST3P01034 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CST3P01034 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CST3P01034 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CST3P01034 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CST3P01034 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CST3P01034 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CST3P01034 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CST3P01034 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CST3P01034 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CST3P01034 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CST3P01034 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CST3P01034 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CST3P01034 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST3P01034 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST3P01034 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST3P01034 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST3P01034 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CST3P01034 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST3P01034 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST3P01034 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CST3P01034 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CST3P01034 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CST3P01034 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms