Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F9P00740 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F9P00740 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F9P00740 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F9P00740 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F9P00740 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F9P00740 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F9P00740 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F9P00740 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F9P00740 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F9P00740 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F9P00740 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F9P00740 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F9P00740 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
F9P00740 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms