Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms