Protein–RNA interactions for Protein: O95718

ESRRB, Steroid hormone receptor ERR2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRBO95718 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ESRRBO95718 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRBO95718 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRBO95718 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRBO95718 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRBO95718 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ESRRBO95718 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRBO95718 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRBO95718 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRBO95718 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRBO95718 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRBO95718 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRBO95718 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ESRRBO95718 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ESRRBO95718 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ESRRBO95718 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ESRRBO95718 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ESRRBO95718 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRBO95718 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRBO95718 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRBO95718 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRBO95718 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ESRRBO95718 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms