Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UFL1O94874 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UFL1O94874 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UFL1O94874 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UFL1O94874 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UFL1O94874 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UFL1O94874 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UFL1O94874 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UFL1O94874 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UFL1O94874 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UFL1O94874 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UFL1O94874 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UFL1O94874 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UFL1O94874 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UFL1O94874 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UFL1O94874 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UFL1O94874 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UFL1O94874 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UFL1O94874 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UFL1O94874 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UFL1O94874 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UFL1O94874 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UFL1O94874 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UFL1O94874 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UFL1O94874 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UFL1O94874 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UFL1O94874 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UFL1O94874 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UFL1O94874 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms