Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFASCO94856 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFASCO94856 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFASCO94856 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFASCO94856 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFASCO94856 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFASCO94856 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFASCO94856 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFASCO94856 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFASCO94856 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFASCO94856 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFASCO94856 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFASCO94856 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFASCO94856 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFASCO94856 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFASCO94856 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFASCO94856 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFASCO94856 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFASCO94856 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFASCO94856 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFASCO94856 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFASCO94856 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFASCO94856 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFASCO94856 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFASCO94856 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFASCO94856 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFASCO94856 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFASCO94856 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFASCO94856 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFASCO94856 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFASCO94856 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFASCO94856 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFASCO94856 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms