Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLOT1O75955 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLOT1O75955 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLOT1O75955 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms