Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BBOX1O75936 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BBOX1O75936 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms