Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKAP2O75563 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms