Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F6O75461 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F6O75461 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F6O75461 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F6O75461 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F6O75461 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F6O75461 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F6O75461 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F6O75461 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F6O75461 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F6O75461 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
E2F6O75461 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F6O75461 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F6O75461 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F6O75461 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F6O75461 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms