Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA2O75334 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA2O75334 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA2O75334 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms