Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF2O60811 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRAMEF2O60811 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms