Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CREB3O43889 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3O43889 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3O43889 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3O43889 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3O43889 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3O43889 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3O43889 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3O43889 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3O43889 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3O43889 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3O43889 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms