Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCXO43602 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCXO43602 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCXO43602 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCXO43602 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCXO43602 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCXO43602 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCXO43602 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCXO43602 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCXO43602 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCXO43602 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCXO43602 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCXO43602 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCXO43602 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms