Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1GO43497 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1GO43497 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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