Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SYNJ1O43426 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SYNJ1O43426 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SYNJ1O43426 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYNJ1O43426 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC37■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SYNJ1O43426 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYNJ1O43426 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms