Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COCHO43405 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COCHO43405 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COCHO43405 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COCHO43405 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COCHO43405 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COCHO43405 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COCHO43405 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COCHO43405 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COCHO43405 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COCHO43405 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COCHO43405 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COCHO43405 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COCHO43405 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COCHO43405 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COCHO43405 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COCHO43405 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COCHO43405 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COCHO43405 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COCHO43405 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms