Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA2O43364 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms