Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSI1O43347 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSI1O43347 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSI1O43347 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSI1O43347 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSI1O43347 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSI1O43347 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSI1O43347 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSI1O43347 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms