Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMINO43313 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMINO43313 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMINO43313 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMINO43313 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMINO43313 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMINO43313 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATMINO43313 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATMINO43313 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATMINO43313 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATMINO43313 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATMINO43313 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMINO43313 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMINO43313 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMINO43313 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMINO43313 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMINO43313 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMINO43313 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATMINO43313 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATMINO43313 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMINO43313 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMINO43313 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMINO43313 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMINO43313 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMINO43313 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATMINO43313 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATMINO43313 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMINO43313 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMINO43313 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMINO43313 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMINO43313 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMINO43313 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMINO43313 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATMINO43313 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATMINO43313 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATMINO43313 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATMINO43313 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATMINO43313 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATMINO43313 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATMINO43313 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATMINO43313 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATMINO43313 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATMINO43313 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms