Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP3K13O43283 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP3K13O43283 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms