Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBDO15205 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBDO15205 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBDO15205 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBDO15205 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBDO15205 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBDO15205 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBDO15205 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBDO15205 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBDO15205 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBDO15205 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBDO15205 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBDO15205 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBDO15205 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBDO15205 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms