Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms