Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A2O14975 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms