Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN9O14815 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms