Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD1O14646 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD1O14646 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD1O14646 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD1O14646 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD1O14646 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD1O14646 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD1O14646 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CHD1O14646 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CHD1O14646 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHD1O14646 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHD1O14646 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHD1O14646 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHD1O14646 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHD1O14646 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CHD1O14646 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHD1O14646 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHD1O14646 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CHD1O14646 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHD1O14646 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CHD1O14646 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD1O14646 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD1O14646 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD1O14646 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD1O14646 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD1O14646 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD1O14646 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD1O14646 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CHD1O14646 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CHD1O14646 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHD1O14646 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHD1O14646 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHD1O14646 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CHD1O14646 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CHD1O14646 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHD1O14646 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHD1O14646 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHD1O14646 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CHD1O14646 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHD1O14646 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHD1O14646 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHD1O14646 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHD1O14646 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHD1O14646 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHD1O14646 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHD1O14646 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHD1O14646 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHD1O14646 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHD1O14646 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHD1O14646 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHD1O14646 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHD1O14646 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHD1O14646 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CHD1O14646 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
CHD1O14646 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms