Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF879B4DU55 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF879B4DU55 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms