Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BECN2A8MW95 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BECN2A8MW95 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms