Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL1BA8MQ27 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms