Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCAF2A6NFQ2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCAF2A6NFQ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms