Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
GOLGA6L3A6NEY3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6L3A6NEY3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms