Protein–RNA interactions for Protein: A6NDX5

ZNF840P, Putative zinc finger protein 840, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF840PA6NDX5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF840PA6NDX5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF840PA6NDX5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms