Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C5orf51A6NDU8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms