Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM49BA6NDI0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49BA6NDI0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms