Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms