Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SSPOA2VEC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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