Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCRBV5S1A1TA0A578 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV5S1A1TA0A578 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms