Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RQS6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RQS6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms