Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0J9YXV3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms