Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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NPIPB9F8W1W9 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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NPIPB9F8W1W9 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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NPIPB9F8W1W9 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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NPIPB9F8W1W9 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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NPIPB9F8W1W9 AP001198.1-201ENST00000586278 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NPIPB9F8W1W9 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NPIPB9F8W1W9 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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