Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ISG20L2-201ENST00000313146 3303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MPP4-205ENST00000409474 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC01304-201ENST00000425949 1475 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TCF4-222ENST00000564228 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AURKA-207ENST00000395914 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC023043.1-201ENST00000568654 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ARFGAP3-203ENST00000437119 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GRM4-205ENST00000538487 4153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TMEM105-201ENST00000332900 3321 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RNPC3-202ENST00000524631 2013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TMEM239-201ENST00000361033 3892 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PEX12-204ENST00000613219 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CHP1-201ENST00000334660 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FAM107A-204ENST00000464064 2159 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC004453.2-201ENST00000624861 2153 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CHMP2B-203ENST00000471660 2528 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 APOL3-201ENST00000349314 2117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TCHP-201ENST00000312777 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 POGLUT1-201ENST00000295588 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ELMSAN1-204ENST00000423556 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CA13-201ENST00000321764 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 C16orf96-201ENST00000444310 3823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL390728.2-201ENST00000400933 1670 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PPM1K-209ENST00000514204 2962 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC005324.4-204ENST00000413242 4262 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 HMOX2-202ENST00000398595 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RAD51C-201ENST00000337432 2591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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