Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYV3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
V9GYV3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYV3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYV3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYV3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
V9GYV3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
V9GYV3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
V9GYV3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYV3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYV3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYV3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYV3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms