Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
V9GYQ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
V9GYQ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
V9GYQ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
V9GYQ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
V9GYQ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
V9GYQ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
V9GYQ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
V9GYQ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
V9GYQ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
V9GYQ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
V9GYQ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
V9GYQ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
V9GYQ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
V9GYQ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
V9GYQ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
V9GYQ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
V9GYQ6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
V9GYQ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
V9GYQ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
V9GYQ6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms