Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
LAMC3Q9Y6N6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
LAMC3Q9Y6N6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
LAMC3Q9Y6N6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms