Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP20Q9Y6A4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP20Q9Y6A4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms