Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KPTNQ9Y664 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KPTNQ9Y664 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms