Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNX8Q9Y5X2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms