Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB13Q9Y5F0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB13Q9Y5F0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms