Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF6Q9Y4K3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms